L'agente di polizia Matsumoto indaga da anni su di una serie di efferati omicidi compiuti da un serial killer, senza però aver ottenuto alcun risultato. Proprio quando i crimini stanno per cadere in prescrizione, le indagini sembrano prendere una svolta decisiva: finalmente vengono rinvenute le tracce di un misterioso uomo che va sempre in giro fischiettando e che sembra coinvolto in tutta la faccenda. Sarà lui il colpevole? Anche questa volta l'aiuto di Conan sarà fondamentale per districare la matassa di misteri.